Protein–RNA interactions for Protein: O75678

RFPL2, Ret finger protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL2O75678 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RFPL2O75678 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RFPL2O75678 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFPL2O75678 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms