Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TULP3O75386 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TULP3O75386 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TULP3O75386 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TULP3O75386 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP3O75386 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP3O75386 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP3O75386 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TULP3O75386 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP3O75386 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP3O75386 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP3O75386 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP3O75386 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP3O75386 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP3O75386 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP3O75386 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP3O75386 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP3O75386 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP3O75386 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP3O75386 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TULP3O75386 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP3O75386 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP3O75386 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP3O75386 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP3O75386 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TULP3O75386 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP3O75386 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP3O75386 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP3O75386 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP3O75386 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP3O75386 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP3O75386 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP3O75386 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TULP3O75386 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TULP3O75386 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP3O75386 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP3O75386 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP3O75386 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TULP3O75386 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TULP3O75386 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TULP3O75386 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TULP3O75386 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TULP3O75386 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TULP3O75386 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TULP3O75386 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP3O75386 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP3O75386 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP3O75386 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP3O75386 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TULP3O75386 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TULP3O75386 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TULP3O75386 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TULP3O75386 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TULP3O75386 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TULP3O75386 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TULP3O75386 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TULP3O75386 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TULP3O75386 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TULP3O75386 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TULP3O75386 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP3O75386 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP3O75386 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP3O75386 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TULP3O75386 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TULP3O75386 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TULP3O75386 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TULP3O75386 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TULP3O75386 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TULP3O75386 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TULP3O75386 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP3O75386 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP3O75386 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP3O75386 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP3O75386 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP3O75386 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TULP3O75386 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP3O75386 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP3O75386 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP3O75386 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TULP3O75386 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP3O75386 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP3O75386 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP3O75386 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP3O75386 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP3O75386 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP3O75386 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TULP3O75386 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP3O75386 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP3O75386 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP3O75386 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP3O75386 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP3O75386 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP3O75386 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP3O75386 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP3O75386 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TULP3O75386 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TULP3O75386 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TULP3O75386 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TULP3O75386 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TULP3O75386 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms