Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDH16O75309 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH16O75309 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH16O75309 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH16O75309 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CDH16O75309 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH16O75309 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH16O75309 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH16O75309 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH16O75309 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH16O75309 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH16O75309 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH16O75309 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH16O75309 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDH16O75309 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDH16O75309 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH16O75309 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH16O75309 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH16O75309 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH16O75309 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH16O75309 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH16O75309 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH16O75309 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDH16O75309 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH16O75309 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH16O75309 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH16O75309 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH16O75309 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH16O75309 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH16O75309 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH16O75309 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH16O75309 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH16O75309 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH16O75309 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH16O75309 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH16O75309 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH16O75309 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH16O75309 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH16O75309 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH16O75309 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH16O75309 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH16O75309 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH16O75309 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH16O75309 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH16O75309 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH16O75309 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH16O75309 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH16O75309 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH16O75309 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH16O75309 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH16O75309 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH16O75309 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH16O75309 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH16O75309 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH16O75309 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH16O75309 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH16O75309 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH16O75309 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH16O75309 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH16O75309 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH16O75309 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH16O75309 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH16O75309 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH16O75309 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH16O75309 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH16O75309 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH16O75309 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH16O75309 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH16O75309 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH16O75309 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH16O75309 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH16O75309 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH16O75309 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH16O75309 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH16O75309 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH16O75309 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH16O75309 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH16O75309 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH16O75309 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH16O75309 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH16O75309 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH16O75309 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH16O75309 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH16O75309 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH16O75309 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH16O75309 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH16O75309 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH16O75309 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH16O75309 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH16O75309 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH16O75309 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH16O75309 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH16O75309 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH16O75309 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH16O75309 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH16O75309 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDH16O75309 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH16O75309 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDH16O75309 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDH16O75309 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms