Protein–RNA interactions for Protein: O43790

KRT86, Keratin, type II cuticular Hb6, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT86O43790 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT86O43790 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT86O43790 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT86O43790 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT86O43790 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT86O43790 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT86O43790 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT86O43790 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT86O43790 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT86O43790 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT86O43790 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT86O43790 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT86O43790 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT86O43790 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT86O43790 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT86O43790 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT86O43790 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT86O43790 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT86O43790 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT86O43790 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT86O43790 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT86O43790 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT86O43790 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT86O43790 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT86O43790 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT86O43790 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT86O43790 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT86O43790 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT86O43790 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT86O43790 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT86O43790 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT86O43790 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT86O43790 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT86O43790 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT86O43790 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT86O43790 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT86O43790 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT86O43790 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT86O43790 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT86O43790 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT86O43790 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT86O43790 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT86O43790 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT86O43790 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT86O43790 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT86O43790 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT86O43790 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT86O43790 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT86O43790 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT86O43790 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT86O43790 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT86O43790 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT86O43790 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT86O43790 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT86O43790 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT86O43790 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT86O43790 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT86O43790 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT86O43790 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT86O43790 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT86O43790 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT86O43790 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT86O43790 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT86O43790 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT86O43790 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT86O43790 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT86O43790 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT86O43790 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT86O43790 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT86O43790 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT86O43790 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT86O43790 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT86O43790 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT86O43790 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT86O43790 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT86O43790 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT86O43790 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT86O43790 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT86O43790 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT86O43790 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT86O43790 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT86O43790 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT86O43790 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT86O43790 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 664.5 ms