Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPN9O14815 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPN9O14815 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CAPN9O14815 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CAPN9O14815 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms