Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CITO14578 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CITO14578 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CITO14578 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CITO14578 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CITO14578 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CITO14578 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CITO14578 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CITO14578 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CITO14578 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CITO14578 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CITO14578 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CITO14578 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CITO14578 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CITO14578 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CITO14578 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CITO14578 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CITO14578 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CITO14578 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CITO14578 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CITO14578 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CITO14578 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CITO14578 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CITO14578 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CITO14578 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CITO14578 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CITO14578 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CITO14578 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CITO14578 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CITO14578 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CITO14578 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CITO14578 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CITO14578 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CITO14578 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CITO14578 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CITO14578 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CITO14578 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
CITO14578 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CITO14578 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CITO14578 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CITO14578 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CITO14578 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CITO14578 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CITO14578 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CITO14578 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CITO14578 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CITO14578 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CITO14578 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CITO14578 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CITO14578 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CITO14578 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CITO14578 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CITO14578 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CITO14578 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CITO14578 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CITO14578 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CITO14578 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CITO14578 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CITO14578 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CITO14578 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CITO14578 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CITO14578 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CITO14578 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CITO14578 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CITO14578 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CITO14578 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CITO14578 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CITO14578 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CITO14578 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CITO14578 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CITO14578 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CITO14578 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CITO14578 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CITO14578 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CITO14578 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CITO14578 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CITO14578 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CITO14578 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CITO14578 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CITO14578 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CITO14578 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CITO14578 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CITO14578 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CITO14578 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CITO14578 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CITO14578 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CITO14578 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CITO14578 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CITO14578 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CITO14578 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CITO14578 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CITO14578 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CITO14578 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CITO14578 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CITO14578 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CITO14578 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CITO14578 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CITO14578 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CITO14578 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CITO14578 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms