Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
J3QQQ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QQQ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QQQ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QQQ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QQQ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QQQ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QQQ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QQQ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QQQ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QQQ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QQQ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
J3QQQ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QQQ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QQQ9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QQQ9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QQQ9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QQQ9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QQQ9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QQQ9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QQQ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
J3QQQ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QQQ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QQQ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QQQ9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QQQ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QQQ9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QQQ9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QQQ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QQQ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
J3QQQ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
J3QQQ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
J3QQQ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QQQ9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QQQ9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QQQ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QQQ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QQQ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QQQ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QQQ9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QQQ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QQQ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
J3QQQ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QQQ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QQQ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QQQ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QQQ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QQQ9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
J3QQQ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QQQ9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QQQ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QQQ9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QQQ9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QQQ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QQQ9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QQQ9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QQQ9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
J3QQQ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QQQ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QQQ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QQQ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QQQ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QQQ9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QQQ9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QQQ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
J3QQQ9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QQQ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QQQ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QQQ9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QQQ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QQQ9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QQQ9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QQQ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QQQ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QQQ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
J3QQQ9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
J3QQQ9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms