Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8VRH5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8VRH5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8VRH5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8VRH5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8VRH5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8VRH5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8VRH5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
F8VRH5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
F8VRH5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8VRH5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
F8VRH5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8VRH5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8VRH5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8VRH5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8VRH5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
F8VRH5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8VRH5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8VRH5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8VRH5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8VRH5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8VRH5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
F8VRH5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8VRH5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8VRH5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8VRH5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8VRH5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
F8VRH5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
F8VRH5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
F8VRH5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8VRH5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8VRH5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8VRH5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8VRH5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8VRH5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8VRH5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8VRH5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8VRH5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8VRH5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
F8VRH5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8VRH5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8VRH5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8VRH5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8VRH5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8VRH5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8VRH5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8VRH5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
F8VRH5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8VRH5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8VRH5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8VRH5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8VRH5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8VRH5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8VRH5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8VRH5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8VRH5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8VRH5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8VRH5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
F8VRH5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8VRH5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8VRH5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8VRH5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8VRH5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8VRH5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8VRH5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8VRH5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8VRH5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
F8VRH5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8VRH5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8VRH5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8VRH5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8VRH5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8VRH5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8VRH5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8VRH5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8VRH5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8VRH5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8VRH5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8VRH5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8VRH5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8VRH5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8VRH5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8VRH5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8VRH5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
F8VRH5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F8VRH5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F8VRH5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8VRH5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8VRH5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8VRH5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8VRH5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8VRH5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8VRH5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8VRH5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8VRH5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8VRH5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8VRH5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
F8VRH5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8VRH5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms