Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIPT2A6NK58 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LIPT2A6NK58 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LIPT2A6NK58 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms