Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT87PA6NCN2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT87PA6NCN2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT87PA6NCN2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms