Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEC24CP53992 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms