RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536229.7

SALL3-201, Transcript of spalt like transcription factor 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SALL3, Length 3,997 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3-201ENST00000536229 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.37■■■□□ 2.13
SALL3-201ENST00000536229 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.15■■□□□ 1.78
SALL3-201ENST00000536229 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.12■■□□□ 1.77
SALL3-201ENST00000536229 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SALL3-201ENST00000536229 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.37■■□□□ 1.65
SALL3-201ENST00000536229 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
SALL3-201ENST00000536229 HRCP23327 699 aa25.11■■□□□ 1.61
SALL3-201ENST00000536229 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
SALL3-201ENST00000536229 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.65■■□□□ 1.54
SALL3-201ENST00000536229 MYT1Q01538 1121 aa24.61■■□□□ 1.53
SALL3-201ENST00000536229 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.31■■□□□ 1.48
SALL3-201ENST00000536229 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.47
SALL3-201ENST00000536229 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.19■■□□□ 1.46
SALL3-201ENST00000536229 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
SALL3-201ENST00000536229 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SALL3-201ENST00000536229 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SALL3-201ENST00000536229 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
SALL3-201ENST00000536229 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.82■■□□□ 1.4
SALL3-201ENST00000536229 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
SALL3-201ENST00000536229 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
SALL3-201ENST00000536229 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
SALL3-201ENST00000536229 TRIM41Q8WV44 630 aa23.78■■□□□ 1.4
SALL3-201ENST00000536229 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.75■■□□□ 1.39
SALL3-201ENST00000536229 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
SALL3-201ENST00000536229 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SALL3-201ENST00000536229 NEUROD1Q13562 356 aa23.46■■□□□ 1.35
SALL3-201ENST00000536229 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SALL3-201ENST00000536229 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
SALL3-201ENST00000536229 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.25■■□□□ 1.31
SALL3-201ENST00000536229 ABCC9O60706 1549 aa23.22■■□□□ 1.31
SALL3-201ENST00000536229 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SALL3-201ENST00000536229 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.14■■□□□ 1.29
SALL3-201ENST00000536229 SCRIBQ14160 1630 aa23.07■■□□□ 1.28
SALL3-201ENST00000536229 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SALL3-201ENST00000536229 BCANQ96GW7 911 aa22.84■■□□□ 1.25
SALL3-201ENST00000536229 BCL11AQ9H165 835 aa22.84■■□□□ 1.25
SALL3-201ENST00000536229 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.82■■□□□ 1.24
SALL3-201ENST00000536229 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SALL3-201ENST00000536229 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SALL3-201ENST00000536229 NEFLP07196 543 aa22.68■■□□□ 1.22
SALL3-201ENST00000536229 APLP2Q06481 763 aa22.66■■□□□ 1.22
SALL3-201ENST00000536229 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
SALL3-201ENST00000536229 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.59■■□□□ 1.21
SALL3-201ENST00000536229 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SALL3-201ENST00000536229 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.52■■□□□ 1.2
SALL3-201ENST00000536229 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.5■■□□□ 1.19
SALL3-201ENST00000536229 MIER1Q8N108 512 aa22.43■■□□□ 1.18
SALL3-201ENST00000536229 ITGAEP38570 1179 aa22.32■■□□□ 1.16
SALL3-201ENST00000536229 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.31■■□□□ 1.16
SALL3-201ENST00000536229 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.29■■□□□ 1.16
SALL3-201ENST00000536229 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SALL3-201ENST00000536229 FKBP8Q14318 412 aa22.17■■□□□ 1.14
SALL3-201ENST00000536229 WIZO95785 1651 aa22.09■■□□□ 1.13
SALL3-201ENST00000536229 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SALL3-201ENST00000536229 ABCC8Q09428 1581 aa22.06■■□□□ 1.12
SALL3-201ENST00000536229 SOGA1O94964 1423 aa22.05■■□□□ 1.12
SALL3-201ENST00000536229 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SALL3-201ENST00000536229 CEP162Q5TB80 1403 aa22■■□□□ 1.11
SALL3-201ENST00000536229 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.99■■□□□ 1.11
SALL3-201ENST00000536229 NACADO15069 1562 aa21.99■■□□□ 1.11
SALL3-201ENST00000536229 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.99■■□□□ 1.11
SALL3-201ENST00000536229 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SALL3-201ENST00000536229 NBR1Q14596 966 aa21.96■■□□□ 1.11
SALL3-201ENST00000536229 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SALL3-201ENST00000536229 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
SALL3-201ENST00000536229 CLSPNQ9HAW4 1339 aa21.83■■□□□ 1.09
SALL3-201ENST00000536229 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.82■■□□□ 1.08
SALL3-201ENST00000536229 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SALL3-201ENST00000536229 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SALL3-201ENST00000536229 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SALL3-201ENST00000536229 P3H3Q8IVL6 736 aa21.79■■□□□ 1.08
SALL3-201ENST00000536229 TRIM52Q96A61 297 aa21.78■■□□□ 1.08
SALL3-201ENST00000536229 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SALL3-201ENST00000536229 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SALL3-201ENST00000536229 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
SALL3-201ENST00000536229 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.71■■□□□ 1.07
SALL3-201ENST00000536229 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
SALL3-201ENST00000536229 CLIP1P30622 1438 aa21.71■■□□□ 1.07
SALL3-201ENST00000536229 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SALL3-201ENST00000536229 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.63■■□□□ 1.05
SALL3-201ENST00000536229 GOLGA3Q08378 1498 aa21.62■■□□□ 1.05
SALL3-201ENST00000536229 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SALL3-201ENST00000536229 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
SALL3-201ENST00000536229 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SALL3-201ENST00000536229 ANP32CO43423 234 aa21.52■■□□□ 1.04
SALL3-201ENST00000536229 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
SALL3-201ENST00000536229 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SALL3-201ENST00000536229 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SALL3-201ENST00000536229 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.48■■□□□ 1.03
SALL3-201ENST00000536229 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SALL3-201ENST00000536229 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SALL3-201ENST00000536229 EEA1Q15075 1411 aa21.47■■□□□ 1.03
SALL3-201ENST00000536229 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
SALL3-201ENST00000536229 ARID3CA6NKF2 412 aa21.46■■□□□ 1.03
SALL3-201ENST00000536229 SMARCA4P51532 1647 aa21.45■■□□□ 1.02
SALL3-201ENST00000536229 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
SALL3-201ENST00000536229 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.42■■□□□ 1.02
SALL3-201ENST00000536229 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
SALL3-201ENST00000536229 SMARCA2P51531 1590 aa21.41■■□□□ 1.02
SALL3-201ENST00000536229 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 226.8 ms