RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542878.5

MFGE8-203, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MFGE8, Length 1,172 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-203ENST00000542878 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.43■■■■■ 4.7
MFGE8-203ENST00000542878 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.58■■■■□ 3.93
MFGE8-203ENST00000542878 ABCC9O60706 1549 aa38.02■■■■□ 3.68
MFGE8-203ENST00000542878 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.16■■■■□ 3.54
MFGE8-203ENST00000542878 NACADO15069 1562 aa36.94■■■■□ 3.5
MFGE8-203ENST00000542878 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.91■■■■□ 3.5
MFGE8-203ENST00000542878 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.85■■■■□ 3.49
MFGE8-203ENST00000542878 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.85■■■■□ 3.49
MFGE8-203ENST00000542878 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.66■■■■□ 3.46
MFGE8-203ENST00000542878 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.31■■■■□ 3.4
MFGE8-203ENST00000542878 SCRIBQ14160 1630 aa36.01■■■■□ 3.36
MFGE8-203ENST00000542878 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.75■■■■□ 3.31
MFGE8-203ENST00000542878 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.48■■■■□ 3.27
MFGE8-203ENST00000542878 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.42■■■■□ 3.26
MFGE8-203ENST00000542878 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.78■■■■□ 3.16
MFGE8-203ENST00000542878 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.54■■■■□ 3.12
MFGE8-203ENST00000542878 SMARCA4P51532 1647 aa34.51■■■■□ 3.11
MFGE8-203ENST00000542878 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.48■■■■□ 3.11
MFGE8-203ENST00000542878 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.48■■■■□ 3.11
MFGE8-203ENST00000542878 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.28■■■■□ 3.08
MFGE8-203ENST00000542878 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.23■■■■□ 3.07
MFGE8-203ENST00000542878 SMARCA2P51531 1590 aa34.15■■■■□ 3.06
MFGE8-203ENST00000542878 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.15■■■■□ 3.06
MFGE8-203ENST00000542878 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.05■■■■□ 3.04
MFGE8-203ENST00000542878 WIZO95785 1651 aa33.99■■■■□ 3.03
MFGE8-203ENST00000542878 HMGXB3Q12766 1538 aa33.99■■■■□ 3.03
MFGE8-203ENST00000542878 NCAPD3P42695 1498 aa33.95■■■■□ 3.03
MFGE8-203ENST00000542878 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
MFGE8-203ENST00000542878 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
MFGE8-203ENST00000542878 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
MFGE8-203ENST00000542878 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
MFGE8-203ENST00000542878 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.16■■■□□ 2.9
MFGE8-203ENST00000542878 PRDM2Q13029 1718 aa33.13■■■□□ 2.89
MFGE8-203ENST00000542878 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.1■■■□□ 2.89
MFGE8-203ENST00000542878 NESP48681 1621 aa33.03■■■□□ 2.88
MFGE8-203ENST00000542878 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.94■■■□□ 2.86
MFGE8-203ENST00000542878 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.91■■■□□ 2.86
MFGE8-203ENST00000542878 CFTRP13569 1480 aa32.9■■■□□ 2.86
MFGE8-203ENST00000542878 ERCC6Q03468 1493 aa32.78■■■□□ 2.84
MFGE8-203ENST00000542878 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.76■■■□□ 2.83
MFGE8-203ENST00000542878 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.66■■■□□ 2.82
MFGE8-203ENST00000542878 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
MFGE8-203ENST00000542878 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.62■■■□□ 2.81
MFGE8-203ENST00000542878 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.48■■■□□ 2.79
MFGE8-203ENST00000542878 WDR62O43379 1518 aa32.41■■■□□ 2.78
MFGE8-203ENST00000542878 CUX2O14529 1486 aa32.32■■■□□ 2.76
MFGE8-203ENST00000542878 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
MFGE8-203ENST00000542878 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.28■■■□□ 2.76
MFGE8-203ENST00000542878 ABCC8Q09428 1581 aa32.23■■■□□ 2.75
MFGE8-203ENST00000542878 TOPBP1Q92547 1522 aa32.21■■■□□ 2.75
MFGE8-203ENST00000542878 CUX1P39880 1505 aa32.12■■■□□ 2.73
MFGE8-203ENST00000542878 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.11■■■□□ 2.73
MFGE8-203ENST00000542878 TOP2BQ02880 1626 aa32.04■■■□□ 2.72
MFGE8-203ENST00000542878 SYNJ1O43426 1573 aa32.03■■■□□ 2.72
MFGE8-203ENST00000542878 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.01■■■□□ 2.72
MFGE8-203ENST00000542878 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.95■■■□□ 2.7
MFGE8-203ENST00000542878 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.94■■■□□ 2.7
MFGE8-203ENST00000542878 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
MFGE8-203ENST00000542878 WDR97A6NE52 1622 aa31.89■■■□□ 2.7
MFGE8-203ENST00000542878 IFT140Q96RY7 1462 aa31.89■■■□□ 2.7
MFGE8-203ENST00000542878 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.67
MFGE8-203ENST00000542878 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.73■■■□□ 2.67
MFGE8-203ENST00000542878 SOGA1O94964 1423 aa31.72■■■□□ 2.67
MFGE8-203ENST00000542878 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
MFGE8-203ENST00000542878 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.65■■■□□ 2.66
MFGE8-203ENST00000542878 PBRM1Q86U86 1689 aa31.64■■■□□ 2.65
MFGE8-203ENST00000542878 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.63■■■□□ 2.65
MFGE8-203ENST00000542878 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.47■■■□□ 2.635e-7■■■■■ 32.3
MFGE8-203ENST00000542878 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.63
MFGE8-203ENST00000542878 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.44■■■□□ 2.62
MFGE8-203ENST00000542878 TRIM41Q8WV44 630 aa31.39■■■□□ 2.62
MFGE8-203ENST00000542878 GRIN2BQ13224 1484 aa31.39■■■□□ 2.62
MFGE8-203ENST00000542878 CHD1O14646 1710 aa31.36■■■□□ 2.61
MFGE8-203ENST00000542878 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.33■■■□□ 2.61
MFGE8-203ENST00000542878 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.32■■■□□ 2.6
MFGE8-203ENST00000542878 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
MFGE8-203ENST00000542878 KIF27Q86VH2 1401 aa31.31■■■□□ 2.6
MFGE8-203ENST00000542878 ADAMTS12P58397 1594 aa31.3■■■□□ 2.6
MFGE8-203ENST00000542878 CUL7Q14999 1698 aa31.25■■■□□ 2.59
MFGE8-203ENST00000542878 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.25■■■□□ 2.59
MFGE8-203ENST00000542878 SYNJ2O15056 1496 aa31.15■■■□□ 2.58
MFGE8-203ENST00000542878 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.1■■■□□ 2.57
MFGE8-203ENST00000542878 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.07■■■□□ 2.57
MFGE8-203ENST00000542878 EEA1Q15075 1411 aa31.03■■■□□ 2.56
MFGE8-203ENST00000542878 GRIN2AQ12879 1464 aa31.02■■■□□ 2.56
MFGE8-203ENST00000542878 IGF1RP08069 1367 aa31.01■■■□□ 2.55
MFGE8-203ENST00000542878 FBLN2P98095 1184 aa30.93■■■□□ 2.54
MFGE8-203ENST00000542878 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
MFGE8-203ENST00000542878 CEP170Q5SW79 1584 aa30.9■■■□□ 2.54
MFGE8-203ENST00000542878 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.88■■■□□ 2.53
MFGE8-203ENST00000542878 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.88■■■□□ 2.53
MFGE8-203ENST00000542878 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.84■■■□□ 2.53
MFGE8-203ENST00000542878 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.83■■■□□ 2.53
MFGE8-203ENST00000542878 NUP160Q12769 1436 aa30.83■■■□□ 2.53
MFGE8-203ENST00000542878 OSCARQ8IYS5 282 aa30.83■■■□□ 2.53
MFGE8-203ENST00000542878 PRXQ9BXM0 1461 aa30.82■■■□□ 2.52
MFGE8-203ENST00000542878 KIF21BO75037 1637 aa30.81■■■□□ 2.52
MFGE8-203ENST00000542878 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.73■■■□□ 2.51
MFGE8-203ENST00000542878 SHROOM2Q13796 1616 aa30.7■■■□□ 2.51
MFGE8-203ENST00000542878 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
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