Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ54

PMF1-BGLAP, HCG2044777, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1-BGLAPU3KQ54 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PMF1-BGLAPU3KQ54 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PMF1-BGLAPU3KQ54 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PMF1-BGLAPU3KQ54 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms