Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN7Q9Y6W3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN7Q9Y6W3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN7Q9Y6W3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN7Q9Y6W3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms