Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y623

MYH4, Myosin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH4Q9Y623 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYH4Q9Y623 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MYH4Q9Y623 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MYH4Q9Y623 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MYH4Q9Y623 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms