Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAPPC1Q9Y5R8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms