Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COL4A3BPQ9Y5P4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
COL4A3BPQ9Y5P4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms