Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCDHB12Q9Y5F1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCDHB12Q9Y5F1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCDHB12Q9Y5F1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms