Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC41.17■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
RAD54L2Q9Y4B4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC41.11■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
RAD54L2Q9Y4B4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
RAD54L2Q9Y4B4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC41■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC40.98■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
RAD54L2Q9Y4B4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.94■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC40.94■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC40.91■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC40.9■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC40.89■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
RAD54L2Q9Y4B4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms