Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA2Q9UL42 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PNMA2Q9UL42 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PNMA2Q9UL42 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PNMA2Q9UL42 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms