Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDC23Q9UJX2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC23Q9UJX2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC23Q9UJX2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms