Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FOXD3Q9UJU5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FOXD3Q9UJU5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXD3Q9UJU5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms