Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCF2Q9UG63 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCF2Q9UG63 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCF2Q9UG63 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ABCF2Q9UG63 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ABCF2Q9UG63 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ABCF2Q9UG63 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ABCF2Q9UG63 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms