Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CTSFQ9UBX1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTSFQ9UBX1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSFQ9UBX1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms