Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PEMTQ9UBM1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PEMTQ9UBM1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEMTQ9UBM1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms