Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOP53Q9NZM5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NOP53Q9NZM5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOP53Q9NZM5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOP53Q9NZM5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NOP53Q9NZM5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP53Q9NZM5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP53Q9NZM5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NOP53Q9NZM5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NOP53Q9NZM5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NOP53Q9NZM5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NOP53Q9NZM5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms