Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CNTLNQ9NXG0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CNTLNQ9NXG0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CNTLNQ9NXG0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
CNTLNQ9NXG0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.39
CNTLNQ9NXG0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
CNTLNQ9NXG0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CNTLNQ9NXG0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CNTLNQ9NXG0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CNTLNQ9NXG0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CNTLNQ9NXG0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CNTLNQ9NXG0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
CNTLNQ9NXG0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
CNTLNQ9NXG0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CNTLNQ9NXG0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CNTLNQ9NXG0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CNTLNQ9NXG0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms