Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
COMMD8Q9NX08 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COMMD8Q9NX08 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COMMD8Q9NX08 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COMMD8Q9NX08 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
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