Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW7

C2orf42, Uncharacterized protein C2orf42, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf42Q9NWW7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
C2orf42Q9NWW7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
C2orf42Q9NWW7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C2orf42Q9NWW7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms