Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM248Q9NWD8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM248Q9NWD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM248Q9NWD8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms