Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDX18Q9NVP1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX18Q9NVP1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDX18Q9NVP1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDX18Q9NVP1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms