Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ACKR4Q9NPB9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACKR4Q9NPB9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACKR4Q9NPB9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms