Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF3Q9GZM5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF3Q9GZM5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF3Q9GZM5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.4 ms