Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NSD3Q9BZ95 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NSD3Q9BZ95 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
NSD3Q9BZ95 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
NSD3Q9BZ95 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NSD3Q9BZ95 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.7 ms