Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ4

TRIM34, Tripartite motif-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM34Q9BYJ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM34Q9BYJ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM34Q9BYJ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM34Q9BYJ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM34Q9BYJ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM34Q9BYJ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM34Q9BYJ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM34Q9BYJ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM34Q9BYJ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM34Q9BYJ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM34Q9BYJ4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM34Q9BYJ4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM34Q9BYJ4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM34Q9BYJ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM34Q9BYJ4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM34Q9BYJ4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM34Q9BYJ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM34Q9BYJ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM34Q9BYJ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM34Q9BYJ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM34Q9BYJ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM34Q9BYJ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms