Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GSDMCQ9BYG8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSDMCQ9BYG8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMCQ9BYG8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms