Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PACSIN1Q9BY11 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PACSIN1Q9BY11 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PACSIN1Q9BY11 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms