Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW61

DDA1, DET1- and DDB1-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDA1Q9BW61 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DDA1Q9BW61 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDA1Q9BW61 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms