Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW27

NUP85, Nuclear pore complex protein Nup85, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP85Q9BW27 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP85Q9BW27 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NUP85Q9BW27 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP85Q9BW27 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms