Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MYD88Q99836 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
MYD88Q99836 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
MYD88Q99836 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
MYD88Q99836 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 224.2 ms