Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGRRF1Q99675 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGRRF1Q99675 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGRRF1Q99675 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGRRF1Q99675 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGRRF1Q99675 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGRRF1Q99675 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CGRRF1Q99675 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CGRRF1Q99675 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGRRF1Q99675 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CGRRF1Q99675 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CGRRF1Q99675 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms