Protein–RNA interactions for Protein: Q99442

SEC62, Translocation protein SEC62, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC62Q99442 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SEC62Q99442 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SEC62Q99442 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SEC62Q99442 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC62Q99442 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC62Q99442 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC62Q99442 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SEC62Q99442 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SEC62Q99442 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms