Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SCLT1Q96NL6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SCLT1Q96NL6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SCLT1Q96NL6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SCLT1Q96NL6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms