Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNPC3Q96LT9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RNPC3Q96LT9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RNPC3Q96LT9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RNPC3Q96LT9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms