Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
COG3Q96JB2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
COG3Q96JB2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
COG3Q96JB2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
COG3Q96JB2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms