Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
BCANQ96GW7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
BCANQ96GW7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BCANQ96GW7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
BCANQ96GW7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
BCANQ96GW7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms