Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IMP4Q96G21 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
IMP4Q96G21 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
IMP4Q96G21 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IMP4Q96G21 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms