Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ0

SGTB, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTBQ96EQ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGTBQ96EQ0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SGTBQ96EQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SGTBQ96EQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms