Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
LRRC59Q96AG4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRRC59Q96AG4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
LRRC59Q96AG4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRRC59Q96AG4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
LRRC59Q96AG4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms